Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 715749 715750 2 46 [0] [0] 111 mdtH predicted drug efflux system

Only 100 of 111 total aligned reads displayed.

CGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAACG  >  minE/715751‑715797
|                                              
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAct  <  1:1663716/47‑2 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2973546/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:438184/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:437946/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:394543/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:358579/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:3291179/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:3270390/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:313686/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:3103759/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:3094495/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:3035125/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2979622/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:444100/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2870890/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2792350/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2766801/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:273509/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2677846/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2608076/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2552243/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2534821/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2530586/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2511706/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1007852/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:708645/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:95826/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:93269/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:900246/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:892811/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:883318/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:864109/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:857069/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:855721/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:805218/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:790131/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:712262/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2347914/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:698119/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:663675/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:651650/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:641561/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:613688/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:59758/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:578868/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:575717/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:533232/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:523052/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:510565/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1268346/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2332288/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1603757/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1562485/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1550954/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1523404/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1460052/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1452804/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1447387/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1407166/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1296924/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1293625/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1276044/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1606404/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1214103/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1181909/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1174590/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1126916/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1104324/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1080954/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1066313/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1055507/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1054194/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1027272/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1022032/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1976019/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2329298/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2282380/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2232995/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2073859/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2072873/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2065723/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2062839/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2023848/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2003632/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1681579/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1976018/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1975911/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1966901/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1960315/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1944092/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1936254/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1885283/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1833087/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1832491/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:179082/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:1749637/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGAGCCGAAcg  <  1:1468879/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAG‑GCCGAAcg  <  1:895939/46‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGCATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2749546/47‑1 (MQ=255)
cGACCACGCTGCTGTGGACGCATTAATTTCACCACCAGCGCCGAAcg  <  1:2745876/47‑1 (MQ=255)
|                                              
CGACCACGCTGCTGTGGACGGATTAATTTCACCACCAGCGCCGAACG  >  minE/715751‑715797

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑