Missing coverage evidence...
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ATCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACG  >  minE/716992‑717053 |                                                              atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTTATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2212329/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2618798/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:972668/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:945002/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:624646/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:513302/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:496832/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:3133066/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:3126183/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:299939/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2806946/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2757426/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2663555/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2640285/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:1161184/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2538883/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2457301/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:2043442/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:1965491/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:1883438/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:1460409/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:145040/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:1354555/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:1349872/62‑1 (MQ=255) atCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACg  <  1:1289089/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATCAACTTACTGCCCTTGAAGCTCGCGTGATTGGTTGCTTGCTGGAAAAGCAGGTGACCACG  >  minE/716992‑717053

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑