Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	43075	43218	144	6 [0]	[0] 83	[fixC]–[fixX]	[fixC],[fixX]

GTGAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTG  >  minE/43219‑43268 |                                                  gtgAAGGCCTATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2642636/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTTATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:389284/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTTGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:3056659/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTTGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2699259/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:3117805/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:312563/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:3087721/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:3057310/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2876971/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2828491/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2819136/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2755549/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2635428/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2629503/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2616119/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2551219/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2515484/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2475881/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2390501/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2352566/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2293295/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2261808/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:519176/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:975799/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:974468/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:784019/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:765834/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:722360/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:65176/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:631772/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:606478/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:521521/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2223196/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:504849/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:448338/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:424653/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:373332/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:336707/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:3265750/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:3203316/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:3201646/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:3192060/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1422320/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1569873/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1543017/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1522202/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1501251/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1498988/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1490702/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1444846/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1437001/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1423897/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1576844/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:139791/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1344798/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1298229/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1152573/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1148226/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1107064/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1082572/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:103476/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1017661/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1916361/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2199691/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2163049/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2159379/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2111468/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:2084844/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1963179/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1959398/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1945468/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1941494/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1005482/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1855124/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1839242/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1795826/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:17562/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1749346/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1744603/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1687676/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1650551/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1618302/50‑1 (MQ=255) gtgAAGGCCGACGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTg  <  1:1159103/50‑1 (MQ=255) |                                                  GTGAAGGCCGATGCTGATAAACAGGCGCTGGAGCTGCTGGTGAAAGCGTG  >  minE/43219‑43268

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑