Missing coverage evidence...
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GTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAGG  >  minE/764387‑764434 |                                                gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGTGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2826926/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGaa    >  1:1028340/1‑46 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgt  >  1:220847/1‑47 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:464543/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2960883/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2987814/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:3030295/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:3118320/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:3120096/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:3137198/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:320855/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2943483/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:533591/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:597221/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:600655/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:632901/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:633296/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:679482/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:829868/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:88552/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:903632/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:971942/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1620782/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1083145/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1111978/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1346966/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1367409/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1374393/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1451063/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1465359/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1470130/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2954493/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1692514/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1733346/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:1972450/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2071988/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2125233/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2128427/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2594243/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2659634/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAgg  >  1:2673766/1‑48 (MQ=255) gTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAg   >  1:828369/1‑47 (MQ=255) |                                                GTTGCTGTTGACCACCAGAGAGCTGATGCGGTTTGCGTTGAGCGAAGG  >  minE/764387‑764434

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑