Missing coverage evidence...
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ACCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTTTTCCTT  >  minE/777930‑777991 |                                                              aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:604650/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2852588/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:291236/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2951190/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:3065867/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:3155532/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:3205104/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:558451/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:569553/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2596294/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:608482/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:755474/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:760387/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:787057/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:788693/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:836856/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:909757/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2037832/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:121457/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:1241047/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:1317172/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:1372978/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:139460/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:1454753/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:1706295/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:1891168/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:1018737/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2181156/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2222420/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:226289/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2482322/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2483083/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2501406/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:2541344/62‑1 (MQ=255) aCCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCT‑GACGTGGCGCTTtttcctt  <  1:357807/61‑1 (MQ=255) |                                                              ACCGGCGTTGTATTTTGCGCTGGAGCCTGCGGTGTGGGAGCTGGACGTGGCGCTTTTTCCTT  >  minE/777930‑777991

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑