Missing coverage evidence...
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CGGCTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGA  >  minE/799474‑799535 |                                                              cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATATCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:261482/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCTCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2492239/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2980320/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2499560/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2553762/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2555716/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2650765/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2663684/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2678252/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2810770/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2810818/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2836865/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:93042/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:3011882/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:3027300/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:3042544/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:3274770/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:441592/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:572481/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:696236/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:701298/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:704285/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:926035/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2322172/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1096609/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1096908/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1390557/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1421232/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1421953/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1440327/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1453845/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1472437/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1507483/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1721801/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1819659/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:187799/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:191667/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2047894/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2058588/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2063831/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2106302/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2155805/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2200717/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:221445/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2237950/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:2451574/62‑1 (MQ=255) cggcTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCATGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:1064142/62‑1 (MQ=255) cggcAGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGa  <  1:531869/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGGCTGTGGTGTTACCGGTGTTTCTTCTGCCTGCACCGATAGCGCAGCGAAACACAAAAAGA  >  minE/799474‑799535

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑