Missing coverage evidence...
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ACTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTG  >  minE/807216‑807277 |                                                              aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2435534/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:878439/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:801296/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:799813/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:464903/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:461190/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:366734/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:332947/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:3286730/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:319033/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:3165525/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:3141356/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:3133059/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:3009177/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2669690/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2604006/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1084689/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2378305/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2374102/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2371537/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:232760/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2121986/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2108983/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:2108540/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1819705/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1713317/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1653530/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1495718/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1445621/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1374043/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1096617/62‑1 (MQ=255) aCTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTg  <  1:1089774/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACTGGTGACGAGGCCACCGCCCTGCGCGGAAGAAATATGGCTATCTGCACCGATAGTGGTTG  >  minE/807216‑807277

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑