Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	828430	828437	8	49 [0]	[0] 61	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

CGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCG  >  minE/828438‑828499 |                                                              cGCAATTCGATATCACGTAGCAGTGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTAc              >  1:1524251/1‑50 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGTGTTAAATTCTGTAAGCAGTTGAGTACAGGTGACAGCCg  >  1:1417739/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGc   >  1:1700108/1‑61 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGc   >  1:2905132/1‑61 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGc   >  1:2742931/1‑61 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2697533/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2585591/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2747075/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2499677/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2772038/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2820873/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2489192/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2476846/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2916300/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:3047933/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:311028/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:3205281/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:3193718/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2391345/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:3292107/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:346221/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:362731/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:418600/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:565584/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:570928/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:701261/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:762266/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:784993/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:796826/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:872928/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:901199/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:941119/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1580730/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1104225/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:115294/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1174545/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1232745/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1243034/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:132853/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1440561/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1458771/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1460192/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1543996/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1560340/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1578107/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:240490/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1586001/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1702903/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1705980/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1745314/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1756393/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1760325/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1761664/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1830496/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1912671/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2130361/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2329511/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:2373661/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:1038320/1‑62 (MQ=255) cGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTA‑GGGTGACAGGCg  >  1:1162377/1‑61 (MQ=255) cGCAATTCGATAACACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCg  >  1:529605/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGCAATTCGATATCACGTAGCAGGGTTAAATTCTGTAAGCCGTTGAGTACAGGTGACAGGCG  >  minE/828438‑828499

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑