Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	841249	841368	120	19 [0]	[0] 73	rssA	conserved hypothetical protein

ACGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCACGCGTGCA  >  minE/841369‑841430 |                                                              aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2994021/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3116428/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3109525/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3089683/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:307779/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3055345/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3038259/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3031211/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3030568/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3157444/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2970625/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2934738/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2866246/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2843814/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2772160/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2680098/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2381865/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2320319/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:638468/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:996866/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:939527/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:925461/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:850180/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:834138/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:79907/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:729683/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:664926/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1068732/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:593154/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:525494/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:520152/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:475918/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:422282/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:378307/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:3210554/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1374999/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:163392/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1477724/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2265178/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1458524/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1411787/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1409299/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1399187/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1380017/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1470674/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:124142/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1223470/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1210285/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1202115/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:117491/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1100718/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1013518/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1704472/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2264359/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2259158/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2214430/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2069313/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2010205/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1970717/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1965785/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1901170/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1896683/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:188121/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1840998/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1808631/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:1693964/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgc       >  1:1402007/1‑57 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcgc       >  1:861393/1‑57 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCAcg        >  1:2292535/1‑56 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCACGCGTGCa  >  1:1353605/1‑62 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCACTCAcgcg      >  1:53742/1‑58 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTACTATATCCCTCAc         >  1:1330663/1‑55 (MQ=255) aCGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACACAATTCCTATTTCCCTCAcgcg      >  1:2125763/1‑58 (MQ=255) |                                                              ACGGCTACTGGCTGGTTGATGGAGCAGTCGTTAACCCAATTCCTATTTCCCTCACGCGTGCA  >  minE/841369‑841430

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑