Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	842716	842797	82	8 [0]	[0] 81	rssB	response regulator of RpoS

TGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGC  >  minE/842798‑842859 |                                                              tGCAAATCATTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2221741/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:3095573/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:3187350/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:3091160/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:3038497/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:3016179/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:3007095/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2914458/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2908909/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2863948/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2841964/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2795407/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2784043/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2757643/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2693361/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2675880/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2659753/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2633969/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2618227/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2571272/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2497656/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:718268/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:997644/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:962355/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:908014/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:900831/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:853280/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:845586/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:835713/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:800818/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:760492/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2473794/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:716931/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:678285/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:668647/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:649042/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:627965/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:626187/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:57884/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:425784/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:3247460/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1477467/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2481596/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:162346/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1619777/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1611274/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1602312/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1579811/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1538430/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1532573/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1489567/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1742204/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1473467/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1367501/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1337255/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1157580/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1119850/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:111471/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1079079/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1029362/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1025669/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2251492/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:100537/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2421285/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2416507/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2336159/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2311733/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2309867/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2307048/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2261948/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1802141/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2213620/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2202639/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2169882/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2151666/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2044780/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:2011040/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1985449/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1921843/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1834146/62‑1 (MQ=255) tGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAAGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGc  <  1:1391367/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGC  >  minE/842798‑842859

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑