Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	52753	52786	34	61 [0]	[0] 76	imp	exported protein required for envelope biosynthesis and integrity

CGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAT  >  minE/52787‑52848 |                                                              cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTaa                           >  1:2862467/1‑37 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTa                            >  1:1784766/1‑36 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCt                    >  1:2108923/1‑44 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCa   >  1:2200269/1‑61 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2816026/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:3064165/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2987211/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2915135/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:290250/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2892842/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2871915/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:3106608/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2805554/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2803066/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2776204/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2766565/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2746491/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2718314/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2714383/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2684817/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:544328/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:966190/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:825514/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:8047/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:803164/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:798799/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:597033/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:593217/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:575520/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:574971/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:308351/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:519238/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:462498/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:373103/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:351492/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:3263679/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:3227951/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:3113507/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2594990/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1560037/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2617123/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1877082/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1755690/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1714001/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1703615/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1701461/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1570081/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1563777/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:190072/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1482313/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1440446/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1435410/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1387110/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1189738/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1154605/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1150051/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:104272/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2122383/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1033840/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:256516/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2411384/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2268687/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2263473/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2253925/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1952376/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2111406/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2092241/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2039249/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2029785/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2021446/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1990253/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1971469/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCCTCAt  >  1:1157430/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATACAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2178491/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGAGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:1381586/1‑62 (MQ=255) cGTAGCCTGAATATATTACGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAt  >  1:2899097/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGTAGCCTGAATATATTCCGGGCTGGCGTAACGGTAATTCAGCTGTACCAGACGGTCTTCAT  >  minE/52787‑52848

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑