Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	860198	860254	57	52 [1]	[0] 70	trpD	fused glutamine amidotransferase (component II) of anthranilate synthase and anthranilate phosphoribosyl transferase

CACGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTC  >  minE/860255‑860308 |                                                      cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2683335/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2991658/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2967301/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2940575/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:284287/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2840284/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2834376/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2821750/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2799227/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:3043697/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2637822/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2624716/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2615257/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2610407/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2581348/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2510417/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2497614/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2428228/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:479313/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:974391/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:919987/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:768235/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:758881/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:740087/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:576056/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:560441/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:518582/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2414633/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:449397/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:329355/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:3258773/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:3212831/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:3153798/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:3094587/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:3047635/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1543385/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:101095/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1890969/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1882956/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1658792/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1658778/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1587253/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1567842/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1563961/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1924165/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1528123/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1403316/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1374598/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1232636/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1181635/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1147234/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1140855/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2253794/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2401428/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2379224/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2317208/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2295373/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2286801/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2257714/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1925617/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:224986/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:221498/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:221142/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2179316/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:2104965/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1977750/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:194130/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1936934/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGCACGTAAAAGAGTc  <  1:1516842/54‑1 (MQ=255) cacGTTATGCCCATTCCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTc  <  1:1476199/54‑1 (MQ=255) |                                                      CACGTTATGCCCATTGCTGCGCAACTGATCTGCCAGGTTGTACGTAAAAGAGTC  >  minE/860255‑860308

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑