Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	55544	55561	18	9 [0]	[0] 13	djlA	DnaJ‑like protein, membrane anchored

TGATGCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTGG  >  minE/55562‑55623 |                                                              tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:1094421/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:1140134/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:1656176/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:2487946/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:2788462/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:3165185/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:3266364/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:359425/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:397954/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:506193/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:91109/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGAAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:1307874/62‑1 (MQ=255) tgatgCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGGTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTgg  <  1:753079/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGATGCAGGGCGGTGCACAGTTTGGCGGCGGTTATCAGCAGCAAACTGGCGGTGGTAACTGG  >  minE/55562‑55623

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑