Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	882365	882461	97	51 [0]	[0] 78	osmB/yciT	lipoprotein/predicted DNA‑binding transcriptional regulator

ACAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTG  >  minE/882462‑882523 |                                                              aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2954791/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:3268712/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:3245740/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:3183079/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:318273/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:3180401/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:3179824/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:3087621/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:307592/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:3037136/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:3288769/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2887639/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2774107/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:275933/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2735004/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2720144/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:269599/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2616178/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2580253/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2555166/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:714139/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:986785/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:984296/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:966700/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:893133/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:865401/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:851845/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:792182/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:758141/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:734017/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2522710/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:646202/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:633116/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:583935/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:577127/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:563264/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:551055/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:446394/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:334362/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1317487/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1626147/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1603087/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1602751/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1587017/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1572350/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1534174/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1499776/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1462102/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1447670/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1666692/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1270234/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:122176/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1176914/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1172673/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1148378/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1113161/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1058232/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1040761/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1022409/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2057541/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2373400/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2372309/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2357781/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:232357/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2297521/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:229252/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2265827/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2191924/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:219044/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1004136/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:2013912/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:19864/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1899727/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1891737/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1851838/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1783829/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1718734/62‑1 (MQ=255) aCAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg  <  1:1692032/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTG  >  minE/882462‑882523

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑