Missing coverage evidence...
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CGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGAT  >  minE/912563‑912624 |                                                              cGGTGACGCCGTATACGCGCATTTGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2182821/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGTCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2468402/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:3085628/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2468076/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2652239/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:269918/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2828185/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2978678/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2999652/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:3018969/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:3026007/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:302743/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:3032993/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2334543/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:325596/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:3287835/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:340535/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:389028/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:519525/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:533088/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:585264/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:739848/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:855704/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:955550/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:97934/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1727750/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:10198/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:10404/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1099651/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1100903/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1167471/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1240/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1394402/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1462570/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1522186/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1538066/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:160497/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2351845/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1751707/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1824419/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1875495/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1928963/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2070236/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2114453/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2124643/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2124770/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2257169/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:2290551/62‑1 (MQ=255) cGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGgatgat  <  1:1017770/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGGTGACGCCGTATACGCGCATTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGAT  >  minE/912563‑912624

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑