Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	923058	923061	4	13 [0]	[0] 40	ycjZ/mppA	predicted DNA‑binding transcriptional regulator/murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit

CATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGAA  >  minE/923062‑923121 |                                                            cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:509180/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:1074391/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:3009087/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:302046/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:3068954/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:3173171/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:3225634/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:353646/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:401299/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:467075/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2963511/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:515674/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:534209/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:605947/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:626662/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:631163/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:685771/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:725460/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:825738/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2567837/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:119420/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:121133/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:1273517/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:1367774/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:1431114/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:1456750/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:1795071/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:1894472/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2008177/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2035988/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2130220/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2290057/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2292937/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2464298/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2516950/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2523520/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2772842/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGa   >  1:2208897/1‑59 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTCTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:404771/1‑60 (MQ=255) cATTTGATGCTTCCTGTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGaa  >  1:2997526/1‑60 (MQ=255) |                                                            CATTTGATGCTTCCTTTGTCACTTTTTTGATGGAAGTTGTTTGCATTTCTTTAAGGCGAA  >  minE/923062‑923121

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑