Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 60036 60104 69 19 [0] [0] 44 hepA RNA polymerase‑associated helicase protein

CGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTACGACG  >  minE/60105‑60165
|                                                            
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:3096546/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:243572/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2448644/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2459204/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2614362/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2690065/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2796444/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2804635/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2844205/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2894921/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:3058481/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2418579/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:3161288/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:3282058/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:337166/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:387591/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:421026/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:488721/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:634654/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:670947/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:78767/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:97015/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1550115/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1011158/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1192730/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1221564/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1294080/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1382284/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1382765/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1419689/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1458677/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1517336/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1535830/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1004238/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1573991/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:1863414/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:199632/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:200841/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2048189/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2074421/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2087577/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2178343/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2295830/61‑1 (MQ=255)
cGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTacgacg  <  1:2345704/61‑1 (MQ=255)
|                                                            
CGACCACCAGCAGGTCCCATTCGGCTTCACAGAGATGTTCCAGGCGCTGTTTGCTACGACG  >  minE/60105‑60165

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: