Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	981005	981010	6	29 [0]	[0] 41	ydfP	conserved hypothetical protein

CAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAT  >  minE/981011‑981051 |                                         cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGa   >  1:1398570/1‑40 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGa   >  1:1688476/1‑40 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2354362/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:230409/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2396235/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2430032/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2500736/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2595481/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2692091/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2774077/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2815886/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2882134/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:3072739/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:3229678/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:374211/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:420929/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:45466/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:592848/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:644167/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:711069/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:766707/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:811344/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1698839/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1088201/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1144068/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1153949/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1181891/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1220868/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1231547/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1409787/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1593276/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2314137/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1816627/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:197470/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2009103/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2184303/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2195322/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2255173/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:2261634/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1000501/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCGAG‑AGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAt  >  1:1638851/1‑40 (MQ=39) |                                         CAATTATTCGAGCAGCAAATTGAGCATTTACCTCTTGTGAT  >  minE/981011‑981051

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑