Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	989459	989499	41	17 [0]	[0] 44	ynfF	oxidoreductase subunit

AGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACA  >  minE/989500‑989560 |                                                             aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTAGATGGACa  <  1:2900951/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:515335/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2420085/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2498364/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2502254/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2833473/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2855182/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2886856/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2890063/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:3223474/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:3268237/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2330061/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:569461/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:579425/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:58121/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:671398/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:701220/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:742487/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:809440/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:901336/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:917731/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:974356/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1617812/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1077244/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1181505/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1241447/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1258408/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1299135/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1321315/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1394355/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:142129/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1609973/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1061623/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1731915/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1793721/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1868730/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1883994/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1899707/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1902195/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2012537/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2018175/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:205788/61‑1 (MQ=255) aGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:2228161/61‑1 (MQ=255) aGAATGGATCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACa  <  1:1257418/61‑1 (MQ=255) |                                                             AGAATGGTTCCCGATGCTCGAGAATCCTGTTAAAACGCAGATTTCCGTCTTTACATGGACA  >  minE/989500‑989560

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑