Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1002156	1002183	28	84 [0]	[0] 94	ydgG	predicted inner membrane protein

CTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAT  >  minE/1002184‑1002244 |                                                             ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCatcatc                         >  1:477857/1‑38 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGt              >  1:618786/1‑49 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGa   >  1:3092334/1‑60 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGa   >  1:1751799/1‑60 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGa   >  1:3078642/1‑60 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3077718/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3192321/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3186106/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3182274/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3173373/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3170467/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3135687/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3098651/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3086292/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3284637/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3030802/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2991554/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2963318/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2962949/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2853688/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2742493/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2724874/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2690127/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2667007/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2637145/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2596018/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:643285/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:979685/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:906126/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:88378/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:865437/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:861223/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:819819/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:803230/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:75183/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:701715/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:687688/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:3244505/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:570214/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:555679/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:541084/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:536192/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:504866/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:449018/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:426223/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:397699/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:384068/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2594389/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1462737/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1883784/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1881847/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1877719/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:185935/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:18343/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:180811/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1775764/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1625040/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:161798/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1555520/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1539848/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1927189/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1413872/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1395624/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1382053/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1248747/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1227691/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1223688/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1146953/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1143814/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1104340/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:103542/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2280239/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2583663/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2576137/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2566554/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2557525/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2527917/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2513387/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2448797/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2415029/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:239546/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2296276/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2292593/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1012332/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2262893/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2172942/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2138472/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2132004/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2087924/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2056324/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2038057/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:2023507/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1994251/1‑61 (MQ=255) ctcATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAt  >  1:1965976/1‑61 (MQ=255) |                                                             CTCATTATCTGGTGCTGAAAACAGCCATCAGCATCATCACCGGCCTGGTCGCCTGGGCGAT  >  minE/1002184‑1002244

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑