Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1005804	1005852	49	18 [0]	[0] 57	pntA/ydgH	pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/hypothetical protein

GTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAC  >  minE/1005853‑1005914 |                                                              gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTtata   >  1:2838160/1‑61 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:510234/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2878542/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2895424/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2910428/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2944218/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2990258/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:3006406/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:303242/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:3060820/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:3068347/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:3115640/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:3225546/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:3279498/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:434536/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2876663/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:510401/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:565537/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:569650/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:59531/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:601754/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:608786/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:659718/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:675307/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:685436/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:766377/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:802443/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:842249/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:900951/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2176226/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1135248/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1392185/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1410859/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1479089/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1596462/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1640669/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1686358/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1792955/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1852965/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1876084/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1918202/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1928773/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:197070/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:1130718/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:238652/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2413375/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2495923/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2525861/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2559404/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2595974/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2710767/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2749561/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:279669/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2800269/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2839831/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:2843701/1‑62 (MQ=255) gTCGGGTAAAACGAGACATCGCCACGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAc  >  1:331702/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTCGGGTAAAACGAGACATCGCCCCGGCACGAATCACTACTTAACATTAAATTAACTTATAC  >  minE/1005853‑1005914

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑