Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1033438	1033534	97	24 [0]	[0] 57	[rsxA]	[rsxA]

TCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCAACAAC  >  minE/1033535‑1033594 |                                                            tCCGTTTATGGTGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:260183/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGTTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:3034719/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:3232695/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2560176/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2598827/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2699850/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2702607/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2712616/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2841332/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2871975/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2952185/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2979267/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2984133/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:3058122/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:3090520/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2543154/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:328917/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:372605/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:411514/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:430451/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:433122/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:540711/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:580260/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:603687/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:698130/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:81376/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:862208/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:968744/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:979886/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1833876/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1043093/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1122746/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1125067/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1188257/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1245176/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1265832/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1279262/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1434716/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:159460/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1625592/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1667102/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1762772/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1766182/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1030998/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1974148/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:1993332/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2075748/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2081311/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2105172/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:210722/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2110354/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2115580/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2327036/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2372378/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:246081/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:249997/60‑1 (MQ=255) tCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCaacaac  <  1:2532539/60‑1 (MQ=255) |                                                            TCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCAACAAC  >  minE/1033535‑1033594

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑