Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1040333	1040374	42	30 [0]	[0] 33	nth/ydgR	DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase/predicted transporter

CCACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAACGC  >  minE/1040375‑1040414 |                                        ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2402962/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:965782/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:930766/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:724415/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:687983/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:570938/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:373247/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:354342/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:3208793/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:3082207/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2886718/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2852137/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2816246/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2814128/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2673569/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2557531/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1507145/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1129023/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1163955/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1397325/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1430810/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1468726/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1497674/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1505470/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1112549/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1600461/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:1601937/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2003324/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2123449/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2162466/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcgc  >  1:2300360/1‑40 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAAcg   >  1:2251446/1‑39 (MQ=255) ccACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTAAACATAAcgc  >  1:725386/1‑40 (MQ=255) |                                        CCACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAACGC  >  minE/1040375‑1040414

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑