Missing coverage evidence...
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TTCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAT  >  minE/1051337‑1051398 |                                                              ttCTGCGTCCAGGATCTGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1986950/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCTCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2102742/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCTCTGCGCCGGGAt  <  1:2991204/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:351075/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2538693/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2627201/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2654310/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2676713/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2691291/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2901552/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2925318/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:293266/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:3032316/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2420047/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:48122/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:545708/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:550260/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:558516/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:562368/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:582304/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:619441/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:682166/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:715547/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:819419/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:854800/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:944603/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1709380/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1061916/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1137597/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1226057/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1226063/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1256590/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:139705/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1420412/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1452832/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1497677/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1552124/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1682821/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2443562/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1752594/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1972725/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1981930/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2028659/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2036238/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2038509/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2283041/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2360761/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:2418743/62‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAt  <  1:1003649/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTCTGCGTCCAGGATCGGATGCTCGTAAAAGCCGCCGCCATATTCGCGCGCTGCGCCGGGAT  >  minE/1051337‑1051398

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑