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CACTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAGCTGTTCCAGCGTCATGTTTGCCG  >  minE/1094010‑1094071 |                                                              cacaGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAGCTGTTCCAGCGTCATGTTTGCCg  >  1:2222801/1‑62 (MQ=255) cacTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAg                         >  1:2261364/1‑39 (MQ=255) cacTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAg                         >  1:1411605/1‑39 (MQ=255) cacTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAGCTGTTCCAGCGTCAt          >  1:678186/1‑54 (MQ=255) cacTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAGCTGTTCCAGCGTCATGTTTGcc   >  1:372739/1‑61 (MQ=255) cacTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAGCTGTTCCAGCGTCATGTTTGcc   >  1:2881205/1‑61 (MQ=255) cacTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAGCTGTTCCAGCGTCATGTTTGCCg  >  1:334951/1‑62 (MQ=255) cacTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAGCTGTTCCAGCGTCATGTTTGCCg  >  1:2651512/1‑62 (MQ=255) cacTGTGCGCGCTTTCTGCTCTGCATTGAGAGATTCAAGCTGTTCCAGCGTCATGTTTGCCg  >  1:3180707/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑