Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1128317	1128319	3	23 [0]	[0] 28	infC	protein chain initiation factor IF‑3

CGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAG  >  minE/1128320‑1128380 |                                                             cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2538080/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:854770/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:814742/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:649956/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:574285/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:52154/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:3231299/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:3116805/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:3074192/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2962937/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2922825/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2886210/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2644839/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:259749/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:115176/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2534034/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2492912/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2408574/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2015146/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:1936604/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:1688463/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:1586460/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:1578295/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:1540204/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:1496838/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:1291167/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGAGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:2471546/61‑1 (MQ=255) cGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTCAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAg  <  1:1572236/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAG  >  minE/1128320‑1128380

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑