Missing coverage evidence...
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TTGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTTTATT  >  minE/1130275‑1130326 |                                                    ttGCAGTGGTGACCCACCCGATAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:1009354/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAATAAAAATTTGTttatt  >  1:1689192/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:257024/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:951216/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:906592/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:515318/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:470307/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:37952/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:3236800/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:3221870/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:3149466/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:2912761/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:2852988/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:2431227/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:2083182/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:1689629/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:1581568/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:1511641/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:1450028/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:141771/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:1397099/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:131687/1‑52 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTttat   >  1:1998168/1‑51 (MQ=255) ttGCAGTGGTGACCCACACGAAAAATCACATACAAAGAAAAATTTGTttatt  >  1:267314/1‑52 (MQ=255) |                                                    TTGCAGTGGTGACCCACACGAAAGATCACATACAAAGAAAAATTTGTTTATT  >  minE/1130275‑1130326

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑