Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1133701	1133711	11	41 [0]	[0] 43	ydiY	conserved hypothetical protein

CAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCT  >  minE/1133712‑1133770 |                                                           cAGTGTCGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2539349/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCGAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2063933/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:470722/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2613957/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2740151/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2745679/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2757633/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2801858/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:370566/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:433441/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:448681/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2508071/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:472161/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:641610/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:766020/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:793473/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:81059/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:820265/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:828208/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:904233/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:96587/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:972290/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1841832/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1191721/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1256942/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1371926/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1378072/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1469776/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1477152/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1481072/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1497198/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1780993/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:251400/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1870712/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1925731/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1932088/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2132450/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2218272/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2336957/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2347104/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:2508050/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1119021/59‑1 (MQ=255) cAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGAT‑GCAGGAACTGTCTTCAAAAGCt  <  1:1672505/58‑1 (MQ=255) |                                                           CAGTGACGCAAACATGCCCCCCGCCAACATAACGATGGCAGGAACTGTCTTCAAAAGCT  >  minE/1133712‑1133770

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑