Missing coverage evidence...
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TGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTC  >  minE/1137183‑1137244 |                                                              tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:405415/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2720932/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2731110/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2750559/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2882462/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:3007728/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:3070647/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:3196618/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:3230849/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:3271132/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:337912/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:35967/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2709939/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:61937/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:620250/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:637018/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:650626/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:69421/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:694595/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:763925/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:789834/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:83689/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:873673/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:926627/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1923883/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1049121/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1069406/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1089751/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1098906/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:125026/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1422167/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1463574/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1549346/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1558701/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1893653/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:198883/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1991183/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:21314/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2148251/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2194243/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2237525/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2245374/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2311365/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2325995/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:2623673/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGATGGTc  <  1:2402996/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGCTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1010990/62‑1 (MQ=255) tGGATATCTCCCGTCGTAACGAGATGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTc  <  1:1692321/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGGATATCTCCCGTCGTAACGAGCTGCCGGACACCTTAGGTTTACGCATCGATATGGTGGTC  >  minE/1137183‑1137244

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑