Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1143438	1143447	10	19 [0]	[0] 73	katE	hydroperoxidase HPII(III)

AAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAG  >  minE/1143448‑1143508 |                                                             aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2569034/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:3150484/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:3069989/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:3025890/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2961904/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2843633/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:279008/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2744040/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2721190/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:3207853/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2567686/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2542047/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2497840/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2488486/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:24196/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2395916/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2329651/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1054855/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:575839/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:950343/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:894669/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:856867/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:811658/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:797445/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:671516/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:600252/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:595973/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2302990/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:565191/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:444409/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:388926/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:37314/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:350491/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:350317/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:3246570/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1350085/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2286724/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:160968/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1601650/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1567149/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1546364/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1519139/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1489381/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1428693/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1355766/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1609694/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:132726/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1297244/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:12723/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:126212/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1210026/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1197873/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1179098/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1128276/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1898902/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2250043/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:223193/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2204306/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2128530/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2054809/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:2049792/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1995693/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1954617/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1932560/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1615853/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1881942/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1875405/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:1820005/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:164837/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCCATAg  <  1:297028/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGACTATAg  <  1:1677566/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGGGTTGCCTATAg  <  1:2967593/61‑1 (MQ=255) aaaCTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCCGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAg  <  1:510518/61‑1 (MQ=255) |                                                             AAACTGCTCTACTCCCGAATGGGTGAAGTGACTGCGGATGACGGTACGGTGTTGCCTATAG  >  minE/1143448‑1143508

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑