Missing coverage evidence...
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CCAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGATT  >  minE/1154295‑1154356 |                                                              ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:2381385/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:896007/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:834779/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:735796/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:722062/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:692209/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:3288985/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:3077905/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:2951039/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:2933244/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:2762353/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1052760/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:2109835/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:185341/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1567715/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1554798/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1448982/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1294668/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1253726/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1182641/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1158504/62‑1 (MQ=255) ccAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGAtt  <  1:1141112/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCAAACATTCGATTCATATCGCTATGGCAATAACGTTTCCCTTGCTTCAGCGCAGGAGGATT  >  minE/1154295‑1154356

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑