Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1164940	1164998	59	14 [0]	[0] 55	[ynjC]	[ynjC]

TCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGC  >  minE/1164999‑1165060 |                                                              tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGcc                      >  1:1165828/1‑42 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGtt           >  1:671537/1‑53 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTAcc        >  1:1975294/1‑56 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGc      >  1:3008530/1‑58 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:52610/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2494659/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2606672/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2652370/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:269390/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2706326/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2794517/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2814827/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2857601/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2913490/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2929373/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:3080305/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:370564/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2109005/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:532879/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:533292/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:579614/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:670225/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:68864/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:746897/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:876474/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:925862/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:944279/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:960326/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:977149/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1374591/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:10170/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1044530/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:10668/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1083293/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1136468/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1160086/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1174226/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1181276/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1187205/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1291613/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1322804/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1346167/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2165244/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1393904/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1416129/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1599624/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1614059/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1676633/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1784226/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1795254/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1939518/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1993088/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:204742/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:2072112/1‑62 (MQ=255) tCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGc  >  1:1009959/1‑62 (MQ=255) |                                                              TCGCCTGCTTTGTCGTTGACACACTGGCAGGCGTTATTTGCCGATCCACAGTTACCGCAGGC  >  minE/1164999‑1165060

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑