Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	87345	87406	62	27 [0]	[1] 39	ddlB	D‑Alanine:D‑alanine ligase

CCGAGCCGCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATG  >  minE/87405‑87468   |                                                              ccgagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATG‑‑CTACAAGATg  <  1:2990213/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAATAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:680066/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:490999/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:3126668/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:3200976/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:322441/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:3292619/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:3293946/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:446975/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:452981/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:478677/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:309085/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:508919/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:684774/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:792278/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:830478/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:88648/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:915805/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:917056/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:966011/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2405444/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:1412805/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:1434697/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:15271/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:1593240/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:1610469/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:1750850/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:1813295/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2105673/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2289873/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:3095033/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2438522/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2523603/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2607426/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2615764/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2688508/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2734731/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:2814694/62‑1 (MQ=255)   gagccgCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATg  <  1:1076652/62‑1 (MQ=255)   |                                                              CCGAGCCGCGAAGGTTCCAGTGTGGGAATGTCAAAAGTAGTAGCAGAAAATGCTCTACAAGATG  >  minE/87405‑87468

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑