Missing coverage evidence...
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ACACGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTT  >  minE/1221218‑1221279 |                                                              acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCTCTGGTCGATGCTCGACCTGtt  <  1:1308041/62‑1 (MQ=255) acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTTGTCGATGCTCGACCTGtt  <  1:1585543/62‑1 (MQ=255) acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGTCCTGtt  <  1:3193731/62‑1 (MQ=255) acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGtt  <  1:2647104/62‑1 (MQ=255) acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGtt  <  1:2923037/62‑1 (MQ=255) acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGtt  <  1:2881139/62‑1 (MQ=255) acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGtt  <  1:280560/62‑1 (MQ=255) acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGtt  <  1:2776311/62‑1 (MQ=255) acacGCATTCTGTTACTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGtt  <  1:2775821/62‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑