Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1222261	1222331	71	3 [0]	[0] 25	yebT	conserved hypothetical protein

CAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAG  >  minE/1222332‑1222392 |                                                             cAGGGGCTGGAAGTCGGACTGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:1208429/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGTTGGTAAAGTcaca   >  1:633206/1‑60 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTcac    >  1:2988724/1‑59 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTca     >  1:2522861/1‑58 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:880780/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:1119642/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:760061/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:636967/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:535314/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:437243/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:2677601/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:2518997/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:2427513/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:2374184/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:2338867/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:2300458/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:2201106/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:2117592/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:1708458/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:1580776/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:1523406/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:1358126/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:1243958/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAg  >  1:1231382/1‑61 (MQ=255) cAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTCGATTTAAATCCt                  >  1:655359/1‑45 (MQ=255) |                                                             CAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAG  >  minE/1222332‑1222392

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑