Missing coverage evidence...
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AATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCATCT  >  minE/1246188‑1246249 |                                                              aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCgg                         >  1:758178/1‑39 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGttttt                    >  1:1839268/1‑44 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGtttt                     >  1:2774641/1‑43 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATa               >  1:2104633/1‑49 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:1446018/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:921495/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:590006/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:556570/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:511033/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:46678/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:350794/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:3204322/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:3164913/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:3078076/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:2392791/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:2322024/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:2192912/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:2003284/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:1650210/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:1446409/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtct  >  1:1325572/1‑62 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtc   >  1:2417877/1‑61 (MQ=255) aaTCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCAtc   >  1:978728/1‑61 (MQ=255) |                                                              AATCGTTACCTGCTTCGCTCCTGGTAATTTGCTTACCGGTTTTTGCATAAACGCTTCCATCT  >  minE/1246188‑1246249

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑