Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1290028	1290043	16	11 [0]	[0] 46	amn/yeeN	AMP nucleosidase/conserved hypothetical protein

TTATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATATAA  >  minE/1290044‑1290101 |                                                          ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:3156083/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2552114/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2673433/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2760470/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2773226/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2777492/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2795786/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:292587/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2963224/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2974215/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:3125730/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:3135836/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2491754/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:3174939/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:3218050/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:3255381/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:327660/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:431742/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:723870/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:753777/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:842242/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:92352/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:96804/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2048459/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1118533/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1155818/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1164246/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1213877/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:124250/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1309080/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1565261/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1572818/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1635670/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1874347/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2045659/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:1005744/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2091271/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2118666/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2198549/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2203026/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2227208/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:224609/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2352477/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2435000/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2463961/58‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATataa  <  1:2472033/58‑1 (MQ=255) |                                                          TTATGGCTTTAGAATATTTTTATTTCTAATAGACGAGATTTTTCCTGTTATGATATAA  >  minE/1290044‑1290101

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑