Missing coverage evidence...
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ATCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGCTC  >  minE/1294373‑1294427 |                                                       aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2388396/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:954289/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:830765/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:372336/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:368820/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:368468/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:3237854/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:3068992/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2957540/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2621401/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2606146/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2398033/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:1198660/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2273172/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2244653/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2232636/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2180727/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2180215/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:1514308/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:1439742/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:1421485/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:1287624/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:1284214/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGctc  <  1:120399/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGGGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2787763/55‑1 (MQ=255) aTCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGAGGCGATAAGTTCGctc  <  1:2303158/55‑1 (MQ=255) |                                                       ATCACTGACATTAACAACTCTTTCACTGCCTGTGCCTGTGGCGATAAGTTCGCTC  >  minE/1294373‑1294427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑