Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1340611	1340622	12	40 [0]	[0] 28	wcaC	predicted glycosyl transferase

CACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAC  >  minE/1340623‑1340684 |                                                              cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTTATTAc  >  1:815007/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2588594/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:717884/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:444702/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:352435/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:3258857/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:3233219/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:3047429/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2930026/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:276690/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2717858/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2642250/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2617369/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2603680/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:1046897/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2494700/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2448454/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2388868/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2181132/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:2165371/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:1848480/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:1827404/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:16728/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:167090/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:1271091/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:1242215/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:1229161/1‑62 (MQ=255) cacaCCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAc  >  1:1160077/1‑62 (MQ=255) |                                                              CACACCTGCTGCCCCGCCTTCCGCCAGTCGCACATTAAATTGCAAAATATTCATTTAATTAC  >  minE/1340623‑1340684

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑