Missing coverage evidence...
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ATCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAGG  >  minE/1383879‑1383940 |                                                              aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCTCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:1140851/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:888212/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:1024061/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:661926/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:305520/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2938163/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2845298/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2836619/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2658606/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2654768/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2354902/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2278387/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2256168/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2226653/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:2027840/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:1678383/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:1593075/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:1281998/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:1198188/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAgg  >  1:1149397/1‑62 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAg   >  1:2805440/1‑61 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAg   >  1:656520/1‑61 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAg   >  1:790073/1‑61 (MQ=255) aTCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCAAgg  >  1:1276384/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATCCTTGTCGCCAAGGTTCAGCACGCCTGCGCGCAGTTTGACGTCTTTAGTCACCTGCCAGG  >  minE/1383879‑1383940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑