Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1403136	1403240	105	15 [0]	[0] 56	rtn	conserved hypothetical protein

CACAGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCATT  >  minE/1403241‑1403301 |                                                             cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTg               >  1:1504952/1‑48 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCg           >  1:823145/1‑52 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCa    >  1:1120871/1‑59 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCGtt  >  1:2208868/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:3287542/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2475206/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2479240/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2655743/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2688965/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2865674/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2911015/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:3007599/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:3031812/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:3094229/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:311322/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:3208607/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:3224610/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:3233278/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:110259/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:344800/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:363318/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:371455/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:390901/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:418273/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:703803/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:732662/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:784581/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:840727/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:87750/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2041221/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1233941/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1244737/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:147644/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1500970/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1607061/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1708484/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1724848/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1815422/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1816176/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1817709/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1146485/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2052349/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:215332/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1126712/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2219284/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:227457/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2291593/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:1017110/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2341880/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2349434/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAtt  >  1:2466984/1‑61 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAt   >  1:90976/1‑60 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAt   >  1:1875872/1‑60 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAt   >  1:2202766/1‑60 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAt   >  1:2810038/1‑60 (MQ=255) cacaGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCAt   >  1:2457327/1‑60 (MQ=255) |                                                             CACAGCGAAAGCTTTAAAGCAGATATCCAGAAACTGCTCACTTCCCTGCCCGCACACCATT  >  minE/1403241‑1403301

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑