Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1410488	1410551	64	4 [0]	[1] 59	bcr	bicyclomycin/multidrug efflux system

ACTGGCAAGCATGTAGCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTGACG  >  minE/1410527‑1410613                          |                                                              aCTGGCAAGCATGTAGCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAg                           <  1:2638570/62‑1 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAAt                             >  1:2528292/1‑35 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:306526/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1111288/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2513632/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2521784/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2558979/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2646350/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2650210/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:274722/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2797934/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2843691/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2933745/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:298376/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2987912/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:247791/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:3115510/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:3137805/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:3192363/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:3223882/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:3261047/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:347125/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:51474/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:532124/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:558643/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:636563/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:829502/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:874537/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:91973/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:18824/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1189184/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1205998/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1445316/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1464136/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1490908/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1582764/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:160025/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1715102/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1716873/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1717463/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1735412/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1763855/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1770737/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:1879946/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2476570/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2007299/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2009644/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2011099/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2157157/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2163375/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2188117/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2230424/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2326899/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2347707/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2438353/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgacg  >  1:2470997/1‑62 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac   >  1:1912159/1‑61 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac   >  1:2784360/1‑61 (MQ=255)                          cGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac   >  1:2523210/1‑61 (MQ=255)                          |                                                              ACTGGCAAGCATGTAGCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTGACG  >  minE/1410527‑1410613

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑