Missing coverage evidence...
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TATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCG  >  minE/1424088‑1424148 |                                                             tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAgcgc                  >  1:1779498/1‑45 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGccc           >  1:1534848/1‑52 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:2168645/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:926674/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:893825/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:877030/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:392784/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:3279586/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:2622733/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:260050/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:2577785/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:2234738/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:2230763/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:2226740/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:2208438/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1030243/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1962567/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1908099/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1877907/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1864969/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1675500/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1456826/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1420416/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1399341/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:1374386/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCCGTGCACCg  >  1:1062304/1‑61 (MQ=255) tATGCTGAGCAGCACACCACCCCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCg  >  1:506285/1‑61 (MQ=255) |                                                             TATGCTGAGCAGCACACCACCGCGCTTAAGTCCCACTGTCAGCGCCACGCCCGGTGCACCG  >  minE/1424088‑1424148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑