Missing coverage evidence...
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GAAACTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAG  >  minE/1436005‑1436067  |                                                              gAAACTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCC‑CCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:729769/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCTATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:604867/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:478223/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2679895/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2688592/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2735077/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2840239/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2900815/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:293694/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2967891/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2977150/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:301519/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:3076828/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:3266750/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:428527/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2647784/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:481947/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:486367/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:58787/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:618715/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:671705/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:756138/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:772701/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:789471/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:844186/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1889615/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1048374/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1115768/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1115873/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:117885/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1296649/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1437431/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1465345/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1603222/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1825540/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:183589/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1885606/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1022560/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:1989171/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2029444/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2152166/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2193279/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2354389/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2375582/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2379201/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2471873/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2578433/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2598616/62‑1 (MQ=255)  aaaCTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAg  <  1:2600546/62‑1 (MQ=255)  |                                                              GAAACTCCGGCAACACCAGCAGACTGGTATCCGCCGTTTCGATAAGGCGCTGATTGATAAAAG  >  minE/1436005‑1436067

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑