Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1445243	1445275	33	9 [0]	[0] 36	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

AGCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCTTTTTT  >  minE/1445276‑1445337 |                                                              agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACGACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:153758/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:38331/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2807968/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2864546/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2871764/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:3104066/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:3117721/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:3152769/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:3168686/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:3176430/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:374288/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:280380/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:399187/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:487039/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:539089/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:594272/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:603843/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:632250/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:988870/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:1900424/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:1109074/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:117298/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:133982/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:1401085/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:1420191/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:1567835/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:1701230/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:1806657/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:1023993/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:198042/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2212389/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2426855/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2553173/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2654566/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2669429/62‑1 (MQ=255) agCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCtttttt  <  1:2781043/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCTTTTTT  >  minE/1445276‑1445337

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑