Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1447915 1447937 23 76 [0] [0] 17 atoS sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

CGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTC  >  minE/1447938‑1447997
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cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:2255953/60‑1 (MQ=255)
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cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:2521314/60‑1 (MQ=255)
cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:2432246/60‑1 (MQ=255)
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cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:2368729/60‑1 (MQ=255)
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cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:2221327/60‑1 (MQ=255)
cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:2147900/60‑1 (MQ=255)
cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:1289172/60‑1 (MQ=255)
cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:1183945/60‑1 (MQ=255)
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cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:1057698/60‑1 (MQ=255)
cgcCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTCCCGCAGATCACCCTGGTc  <  1:147956/60‑1 (MQ=255)
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CGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTC  >  minE/1447938‑1447997

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: