Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1463421	1463437	17	22 [0]	[0] 74	yfaA	hypothetical protein

TTTTTCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTCAACA  >  minE/1463438‑1463499 |                                                              tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAgcttgct                           >  1:2572993/1‑37 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGttt                >  1:1479732/1‑48 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGc           >  1:3225291/1‑53 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:2030509/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:2351772/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:230860/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:2162327/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:431678/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:2078107/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:2392851/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1061992/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:2003137/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:481605/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1944441/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1904514/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:189995/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1899469/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:2365190/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1874242/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:3291791/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:2739001/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:3127470/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:3096384/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:2846764/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:285430/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:286883/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:30840/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:298173/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:3014685/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:3069916/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1555681/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:960546/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1075395/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:87118/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1082413/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1111259/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1124921/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1150728/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1215210/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:831325/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:124541/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:817583/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1465084/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1527933/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1606575/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:638345/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:632284/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1663511/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1668624/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1677494/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1725651/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1742613/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:174649/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1754748/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1767951/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1777823/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:1782083/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:1782844/62‑1 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:201528/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:394193/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:2766683/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:274109/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:2664428/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:2570414/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:210311/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:1986359/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:1622381/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:1619369/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:1372770/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:1239803/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:1080307/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaac   >  1:1070759/1‑61 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCTATTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  >  1:2931240/1‑62 (MQ=255) tttttCGGCAGTACGCGCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTcaaca  <  1:2454661/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTTTCGGCAGTACGCTCTTCCAGGCCAAAGCTTGCTTGCCAGCGTTTTTTGCCGCTCAACA  >  minE/1463438‑1463499

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑