Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1484964	1484969	6	34 [0]	[0] 45	menF	isochorismate synthase 2

TTCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAACT  >  minE/1484970‑1485031 |                                                              ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:407750/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2492969/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2542375/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:264224/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2863155/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2876852/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2930735/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:3009468/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:3015471/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:308847/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:3205004/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:247179/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:55080/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:578666/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:635603/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:69004/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:808254/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:82124/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:862667/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:933191/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:997954/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:99872/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1832916/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1037157/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1159900/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1215360/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1266467/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1353774/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1362379/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1391156/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1539766/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1562458/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1579363/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:175465/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:1023786/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2121661/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2274309/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2284655/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2294492/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2299573/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2381027/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2389828/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2454934/1‑62 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTCGCGATGGTTTTTATAATCCGCCATCAGCCACTCTCCt      >  1:2061714/1‑58 (MQ=255) ttCCACCACCAGCATGTTCTAGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAAct  >  1:2620838/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTCCACCACCAGCATGTTCTCGCGCTGGTTTTTATCATCCGCCATCAGCCACTCTCCTAACT  >  minE/1484970‑1485031

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑