Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1531645	1531790	146	21 [0]	[0] 39	aroC	chorismate synthase

ACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAG  >  minE/1531791‑1531852 |                                                              aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTc          >  1:1446252/1‑54 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:3177222/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:223805/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:2322866/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:2324285/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:2419599/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:2750252/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:2848969/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:2983681/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:3019533/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:3130398/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:2097537/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:3231548/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:351093/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:391420/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:529660/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:625222/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:865627/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:867674/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:985525/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1513603/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1020996/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1043109/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1090060/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1104253/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1107624/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:121762/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1238048/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1414702/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1014798/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1551550/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1574085/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1694458/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1733578/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1789147/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:1861642/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:19239/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:2048526/1‑62 (MQ=255) aCTTCTTCGCCAAAGCAGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAg  >  1:462830/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACTTCTTCGCCAAAGCGGTTAATGGTACGACCCGGCACGGTAATGCTGGAGGTCGGTTTCAG  >  minE/1531791‑1531852

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑