Missing coverage evidence...
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GAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATC  >  minE/1537694‑1537754 |                                                             gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:192977/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:651634/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:376536/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:3265972/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:2895432/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:2877792/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:2877218/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:2766020/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:2291950/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1989348/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1522719/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1880332/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1879182/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1796240/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1693803/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1675197/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1641366/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:161489/1‑61 (MQ=255) gAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATc  >  1:1528954/1‑61 (MQ=255) |                                                             GAACAACCGGCGCGACGTTGCCTTTATGCTGGCATGGCAGTAACAAGCCGTTAAACAGATC  >  minE/1537694‑1537754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑